Also die ganze untere Leiste funktioniert nicht? Du hast ja in der Mitte den "richtigen" Button und links und rechts die Übersichtstaste und die Rückwärtstaste. Wenn die alle nicht mehr gehen ist das natürlich doof. Es gibt beim S6 noch die Möglichkeit die App an sich zu verkleinern:
Samsung Galaxy S6: Versteckte Features
Ingame schließen wüsste ich nicht, ich meinte die App "Einstellungen" an sich, und dort die Apps auswählen, dort Pokemon Go und dann dort das Schließen erzwingen. Ist zwar umständlich aber sicher besser als das ganze Handy neu zu starten... Aber da kommst Du dann ja auch nicht ran wenn die Tasten alle nicht gehen..